Le microbiote cutané : une cible pour les principes actifs de nouvelle génération

M. Bey (Biovitis - Le Bourg - 15400 Saint Etienne de Chomeil, France) E. Filaire (Greentech - Biopôle Clermont-Limagne 63360 Saint-Beauzire France) J.Y. Berthon (Biovitis et Greentech)

7 mai 2018

La surface de la peau est composée de molécules dérivées de nos cellules cutanées, de notre environnement et des micro-organismes vivant sur notre peau. La composition et la diversité des microorganismes cutanés sont directement liées à des paramètres tels que la température, le pH, l’humidité, la teneur en lipides et le gradient d’oxygène. La caractérisation basée sur les outils Omics (métagénomique, transcriptomique, protéomique ...) a mis en évidence le microbiote comme un écosystème unique pour chaque individu dont le rôle dans les fonctions métaboliques, immunitaires et neurologiques est désormais bien établi [1].

Rôle des espèces commensales

L’un des prochains défis sera de comprendre plus précisément le rôle des espèces commensales composant le microbiote cutané. De nombreuses recherches ont montré que Propionibacterium acnes, maintenant appelé Cutibacterium acnes, comportait différents phylotypes, dont certains étaient liés à la pathogénicité de l’acné. Récemment, Nakatsuji et al. (2017) rapporte que la communauté de bactéries vivant sur la peau humaine normale offre une protection contre S. aureus. Par la suite, une souche isolée de S. hominis A9 provenant d’une peau normale a été utilisée pour produire un Sh-lantibiotics avec une activité sélective et efficace contre S. aureus [2].

Importance de la diversité et et de l’équilibre

La diversité du microbiote cutané est associée à une peau saine. Dans le cas du psoriasis, une méthode de métagénomique à haute résolution a été utilisée pour caractériser le microbiome des patients psoriasiques. Les résultats ont montré une diminution de la diversité et une augmentation de Staphylococcus avec des variations potentielles de niveau de contrainte en tant que déterminants clés du microbiome psoriasique [3]. Une étude comparative intéressante entre le microbiote des indiens yanomami et des citoyens américains a permis de conclure que les indiens yanomami présentaient la plus grande diversité bactérienne et que l’occidentalisation semblait gravement affecter la diversité du microbiome cutané humain [4].

La recherche avancée sur le microbiote cutané a révélé de nouveaux défis. La détermination au niveau de la souche des espèces commensales (Staphylococcus epidermis, Cutibacterium acnes) pourrait aider à trouver de nouvelles cibles spécifiques et des solutions pour rétablir l’équilibre entre les microorganismes. Si l’équilibre du microbiote cutané et la diversité sont complexes à définir, la perte d’équilibre doit être empêchée afin de conserver l’homéostasie microbienne. De nouveaux principes actifs, prenant en compte le microbiote cutané, peuvent créer ou aider à restaurer un environnement pour sa protection et la protection de la peau.

Notes

[1] Grice EA. and Segre JA. : The skin microbiome. (2011) Nat Rev Microbiol. 9(4) : 244–253.

[2] Nakatsuji T., Chen TH., Narala S., Chun KA., Two AM., Yun T., Shafiq F., Kotol PF., Bouslimani A., Melnik AV., Latif H., Kim JN., Lockhart A., Artis K., David G., Taylor P., Streib J., Dorrestein PC., Grier A., Gill SR., Zengler K., Hata TR., Leung DY., Gallo RL. : Antimicrobials from human skin commensal bacteria protect against Staphylococcus aureus and are deficient in atopic dermatitis. (2017) Sci Transl Med. 22 ; 9(378).

[3] Tett A., Pasolli E., Farina S., Truong DT., Asnicar F., Zolfo M., Beghini F., Armanini F., Jousson O., De Sanctis V., Bertorelli R., Girolomoni G., Cristofolini M., Segata N. : Unexplored diversity and strain-level structure of the skin microbiome associated with psoriasis. (2017) NPJ Biofilms Microbiomes. 22 ; 3:14.

[4] Clemente JC., Pehrsson EC., Blaser MJ., Sandhu K., Gao Z., Wang B., Magris M., Hidalgo G., Contreras M., Noya-Alarcón Ó., Lander O., McDonald J., Cox M., Walter J., Oh PL., Ruiz JF., Rodriguez S., Shen N., Song SJ., Metcalf J., Knight R., Dantas G., Dominguez-Bello MG. : The microbiome of uncontacted Amerindians (2015) Sci Adv. 3 ;1(3).